阮乂

阮乂 Yi RUAN 

致公党员

博士

副教授、硕士生导师

浙江省高校领军人才培养计划 (5246人才工程）- 高层次拔尖人才

研究领域：

应用物理、生物物理；

原子力显微、荧光显微、光学和磁场多模态等成像方法及其生物、医学应用研究。

实验室介绍：

浙江工业大学量子精密测量实验室是浙江省重点实验室、省协同创新中心。实验室负责人：林强教授（杰青）。

实验室从2008年开始至今，分别在浙江大学光学研究所、浙江工业大学理学院从事原子磁力仪系统及其应用研究。目前已经形成了包括2名教授、6名副教授、10多名讲师，以生物信息探测为核心研究内容的稳定团队，是浙江省内唯一开展心磁、脑磁等微弱生物磁场测量技术研究的单位，在量子心磁测量仪器研究领域处于国内领先地位。

近5年来，项目团队承担863项目、国防科技项目、国家重点研发计划项目、国家自然科学基金项目等纵向研究项目46项，承担项目合同金额总计达4300万元。

团队在国内外学术期刊发表学术论文100+篇。其中SCI索引检索论文81篇，20篇论文发表在包括Nature Physics、Physical Review Letters、PNAS等在内的领域内权威期刊上。授权发明专利及软件著作权5项，另有20项发明专利进入实质性审查阶段。

- 本科生《生物医学光子学》 32学时

- 研究生《科技论文写作》（双语）32学时

- 研究生《生物医学光学》 48学时

- 主持2021 《示范性双语课程》项目

- 连续7年主持2018-2024 浙江工业大学《暑期国际化课程》

代表论文

1. Y. Ruan;  X. He; LM. Ruan; F. Liu; ZW. Zhang; JQ. Weng; QY. Yan; GY. Zhang; K.  Li; WQ. Zheng; Qiang Lin., Drug Monitoring by Optically Pumped Atomic  Magnetometer, IEEE Photonics Journal, 14(4), pp. 1-5, Aug. 2022, Art no. 3134305, doi: 10.1109/JPHOT.2022.3184050.

2. X. Bi, L. Ruan, Z. Liu, K. Li, Y. Ruan*, W. Zheng*, Q. Lin*，Quantitative analysis of magnetic cobaltparticles with an optically pumped atomic magnetometer, Appl. Phys. Lett. 118, 084101 (2021）

3. Y. Ruan, K. Kao, S. Lefebvre, A. Marchesi, P.J. Corringer, R.K. Hite, S. Scheuring*. Structural titration of receptor ion channel GLIC gating by HS-AFM. Proc. Natl. Acad. Sci, (2018) 10.1073/pnas.1805621115.

4. Y. Ruan, A. Miyagi, X. Wang, M. Chami, O. Boudker*, S. Scheuring*. Direct visualization of glutamate transporter elevator mechanism by high-speed AFM. Proc. Natl. Acad. Sci, Vol. 114 (7) 1584-1588 (2017).

5. Y. Ruan, S. Rezelj, A. Bedina Zavec, G. Anderluh, S. Scheuring*. Listeriolysin O membrane damaging activity involves arc formation and lineaction implication for listeria monocytogenes escape from phagocytic vacuole. Plos Pathogens, Vol. 12 (4):e1005597 (2016).

6. Y. Ruan, P. Bon, E. Mudry, G. Maire, P. C. Chaumet*, H. Giovannini, K. Belkebir, A. Talneau, B. Wattellier, S. Monneret, and A. Sentenac. Tomographic diffractive microscopy with a wavefront sensor, Optics Letters, Vol.37, Issue 10, pp. 1631-1633 (2012).

7. T. Zhang, Y. Ruan, G. Maire, D. Sentenac, A. Talneau, K. Belkebir, P.C. Chaumet, A. Sentenac*. Full-polarized Tomographic Diffraction Microscopy Achieves a Resolution about One-Fourth of the Wavelength, Physical Review Letters, Vol 111, pp. 249304 (2013).

8. G. Maire*, Y. Ruan, T. Zhang, P C. Chaumet, H. Giovannini, D. Sentenac, A. Talneau, K. Belkebir, and A. Sentenac. High resolution tomographic diffractive microscopy in reflection configuration. Journal of the Optical Society of America A, Vol. 30, Issue 10, pp. 2133-2139 (2013).

9. S. Arhab, G. Soriano*, Y. Ruan, G. Maire, A. Talneau, D. Sentenac, P. C. Chaumet, K. Belkebir, and H. Giovannini. Nanometric Resolution with Far-Field Optical Profilometry. Physical Review Letters, Vol 111, 053902 (2013).

论著：

1. J. Fang, Y. Ruan, S.Scheuring*, 《Methods in Enzymology Volume649》 – Chapter 7, Elsevier, 2021.May ISBN: 9780128238585

2. Y. Ruan, S.  Scheuring*, 《New Techniques for Studying Biomembranes》 – Chapter V,  Taylor & Francis Group, 2020.Apr ISBN:9781138618060

Articles：

1. Ruan, Y.*, Xiang, Z., Lu, G., Chen, Y., Liu, Y., Liu, F., Wang, J., Zhang, Y., Yao, J., Liu, Y., & Lin, Q. (2024). Non-invasive measurement of rat auditory evoked fields using an optically pumped atomic magnetometer: Effects of task manipulation. Heliyon.https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e31740

2. Peng, Z., Chen, J., Liu, Y., Li, D., Li, Y., Zhang, Q., Chen, C., Zhang, Y., Yao, J., Wang, S., Lin, Q., & Ruan, Y*. (2024). Optical biosensor based on weak measurement for ultra-sensitive detection of calreticulin in human serum. Biomedical optics express, 15(2), 715–724. https://doi.org/10.1364/BOE.514443

3. Liu, F.; Li, D.; Li, Y.; Xiang, Z.; Chen, Y.; Xu, Z.; Lin, Q.; Ruan, Y*. Atomic Magnetometer Achieves Visual Salience Analysis in Drosophila. Sensors (2023), 23, 1092. https://doi.org/10.3390/s23031092

4. DM. Li, CF. Weng, K. Li, Q. Lin, JJ. Zhang, SQ. Wang, Y. Ruan*, and J. Yao, An optical biosensor for the high sensitivity detection of Pertuzumab in Combination with Trastuzumab binding to extracellular domain of HER2, Opt. Express , (2022)

5. Y. Ruan; X. He; LM. Ruan; F. Liu; ZW. Zhang; JQ. Weng; QY. Yan; GY. Zhang; K. Li; WQ. Zheng; Qiang Lin., Drug Monitoring by Optically Pumped Atomic Magnetometer, IEEE Photonics Journal, 14(4), pp. 1-5, Aug. 2022, Art no. 3134305, doi: 10.1109/JPHOT.2022.3184050.

6. Chen, H., Ruan, Y., Yang, C., Zhang, T.*, & Li, K. *(2021). Light harvesting coating design accelerated by deep learning for semi-transparent polymer solar cells. Applied Physics Letters, 119(2), 024102.

7. He, W., Lu, F., Chen, J.*, Ruan, Y., Lu, T., & Zhang, Y. (2021). A Kernel-Based Node Localization in Anisotropic Wireless Sensor Network. Scientific Programming, 2021, 9944358.

8. X. Bi, LM Ruan, ZH Liu, K. Li, Y. Ruan*, Wenqiang, Z.*, & Qiang, L.* (2021). Quantitative analysis of magnetic cobalt particles with an optically pumped atomic magnetometer. Applied Physics Letters, 118, 084101.

9. DM. Li, CF. Weng, K. Li, Q. Lin, JJ. Zhang, SQ. Wang, Y. Ruan*, and J. Yao, Quantification of HER2 in COS7 cells using  quantum weak measurement, Opt. Express, 29, 30337-30347 (2021)

10. Li, D.*, Weng, C., Ruan, Y.,  Li, K., Cai, G., Song, C., & Lin, Q. (2021). An Optical Chiral  Sensor Based on Weak Measurement for the Real-Time Monitoring of Sucrose  Hydrolysis. Sensors (Switzerland), 21(3), 1003.

11. Chen, T., Li, J., Cai, T., Liao, D., Guo, L., Ruan, Y., & Zheng, B.* (2020). Design of a reconfigurable broadband greyscale multiplexed metasurface hologram. Applied Optics, 59(12), 3660-3665.

12. Chen, J.*, Ruan, Y.,  Guo, L., & Lu, H. (2020). BCVehis: A Blockchain-Based Service  Prototype of Vehicle History Tracking for Used-Car Trades in China. IEEE Access, 8, 214842-214851.

13. Li, D.*, He, Y., Ruan, Y., Lin, Q., & Li, K. (2019). Spectrum demodulating polarimeter based on weak measurement with a phase modulation. Journal of Physics D: Applied Physics, 52(47), 475401.

14. Wang, Z., Liao, D., Zhang, T.*, Chen, T., Ruan, Y., & Zheng, B.* (2019). Metasurface-based focus-tunable mirror. Optics Express, 27(21), 30332-30339.

15. Zhang, T., Li, K., Godavarthi, C., & Ruan, Y*. (2019). Tomographic Diffractive Microscopy: A Review of Methods and Recent Developments. Applied Sciences-Basel, 9(18), 3834.

16. Li, K., Zhang, S., Ruan, Y., Li, D., Zhang, T.*, & Zhen, H. (2019). Optimization of Light Management Layers for Light Harvest of Perovskite Solar Cells. Optics Express, 27(16), A1004-A1013.

17. Ruan, Y., Yin, P., Li, F., Li, D., Lin, Q., & Li, K.* (2019). The Accuracy of Determining Cluster Size by Analyzing Ripley's K Function in Single Molecule Localization Microscopy. Applied Sciences-Basel, 9(16), 3271.

18. Tan, Q., Zhu, R., Zheng, B.*, Shen, L., Ruan, Y., & Wang, H. (2019). Achieving panorama using singular metamaterials. Applied Physics Letters, 114(5), 051904.

19. Wang, H.L.*, Yang, A.J., Wang, X., Wu, B., & Ruan, Y. (2018). Pressure dependent modulation instability in photonic crystal fiber filled with argon gas. Chinese Physics B, 27(9).

20. Li, Kan, Wu, Rengmao, Ruan, Yi, & Hongyu Zhen*. (2018). Numerical  analysis of the angular insensitive photovoltaic light harvesting with  the biomimetic scattering film inspired by the rose petal epidermal  topography. Solar Energy, 170, 800-806.

21. Ruan, Yi, Li, Kan, Lin, Qiang, Ting, Zhang*. (2018). Tip-Nanoparticle Near-Field Coupling in Scanning Near-Field Microscopy by Coupled Dipole Method. Chinese Physics Letters, 35(4).

22. 李飞, 张桂迎, 阮乂, 林强, & 童建平*. (2018). 基于磁弛豫技术的磁性纳米粒子肿瘤治疗应用研究进展. 药物生物技术, (05), 438-442.

23. Ruan, Yi, Kao, Kevin, Lefebvre, Solène, & Scheuring, Simon*. (2018). Structural titration of receptor ion channel GLIC gating by HS-AFM. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 115(41), 10333.

24. Ruan, Y., Miyagi, A., Wang, X., Chami, M., Boudker, O.*, & Scheuring, S.* (2017). Direct visualization of glutamate transporter elevator mechanism by high-speed AFM.. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114(7), 1584-1588.

25. Kisovec, M., Rezelj, S., Knap, P., Cajnko, M.M., Caserman, S., Flasker, A., Ruan, Y.,Scheuring, S. & Anderluh, G.* (2017). Engineering a pH responsive pore forming protein. Scientific Reports, 7, 42231.

26. Ruan, Y., Pierre, J.C., & Simon, S*. (2017). Direct Visualization of Conformational Changes Related to Pentameric Receptor Ion Channel GLIC Gating. Biophysical Journal, 112(3, Supplement 1).

27. Ruan, Y., Rezelj, S., Zavec, A.B., Anderluh, G., & Scheuring, S*. (2016). Listeriolysin  O Membrane Damaging Activity Involves Arc Formation and Lineaction -  Implication for Listeria monocytogenes Escape from Phagocytic Vacuole. PLoS Pathogens, 12(4), e1005597.

28. Ruan, Y., Atsushi, M., Xiaoyu, W., Mohamed, C., Henning, S., Olga, B., & Simon, S.* (2016). Direct Visualization of Glutamate Transporter Transport Cycle. Biophysical Journal, 110(3, Supplement 1).

29. Zhang, T., Ruan, Y., Maire, G., Sentenac, D., Talneau, A., Belkebir, K., …& Sentenac, A*. (2013). Full-polarized Tomographic Diffraction Microscopy Achieves a Resolution about One-Fourth of the Wavelength. Physical Review Letters, 111(24), 243904.

30. Maire, G.*, Ruan, Y., Zhang, T., Chaumet, P.C., Giovannini, H., Sentenac, D., …& Sentenac, A. (2013). High-resolution tomographic diffractive microscopy in reflection configuration. Journal of the Optical Society of America A-Optics Image Science and Vision, 30(10), 2133-2139.

31. Arhab, S., Soriano, G.*, Ruan, Y., Maire, G., Talneau, A., Sentenac, D., …& Giovannini, H. (2013). Nanometric Resolution with Far-Field Optical Profilometry. Physical Review Letters, 111(5), 053902.

32. Ruan, Y., Bon, P., Mudry, E., Maire, G., Chaumet, P.C*., Giovannini, H., …& Sentenac, A. (2012). Tomographic diffractive microscopy with a wavefront sensor. Optics Letters, 37(10), 1631-1633.

33. 裴丽*, 宁提纲, 祁春慧, 赵瑞峰, 阮乂, & 简水生. (2010). 高速光通信系统光纤光栅色散补偿的偏振模色散研究. 中国激光, (01), 142-146.

34. 阮乂, 宁提纲*, 裴丽, & 胡旭东. (2009). 高功率双包层光纤激光器的泵浦技术. 光纤与电缆及其应用技术, (01), 22.

35. 阮乂, 裴丽*, 祁春慧, 赵瑞峰, & 宁提纲. (2009). 光纤光栅的V-I传输矩阵法研究. 光学学报, (12), 3267-3271.

36. 裴丽*, 赵瑞峰, 宁提纲, 董小伟, 卫延, 祈春慧, & 阮乂. (2009). 基于光纤光栅辅助耦合的WDM下话路研究. 光学学报, (02), 308-311.

会议报告：

1. Y. Ruan, P. Corringer, S.Scheuring,Direct Visualization of Conformational Changes Related to Pentameric Receptor Ion Glic Gating,Biophysical 61st annual meeting,2017, New Orleans,Louisiana

2. Y. Ruan, A. Miyagi, X. Wang, M. Chami, H. Stahlberg, O. Boudker, S. Scheuring, Direct visualization of GltP h elevator movements by HS-AFM, Membrane Protein Friends, 4-8 may 2016, Porquerolles, FRANCE.

3. Antoine G. Godin, Y. Ruan, P Winckler, L Lartigue, F De Giorgi, F Ichas, G Giannone, JB Sibarita, B Lounis, L Cognet, Super resolution imaging receptor interactions and clustering using Upaint, FiNS 2013, 1-4 Oct, 2013, Bordeaux, FRANCE.

4. Y. Ruan, T. Zhang, E. Mudry, G. Maire, P.C. Chaumet, H. Giovannini, K. Belkebir, A. Talneau, A. Sentenac, Tomographic diffractive microscopy with full vectorial 3D inversion algorithm, FOM, 24-27 mars 2013, Maastricht, NETHERLANDS.

5. Y. Ruan, T. Zhang, G. Maire, P.C. Chaumet, H. Giovannini, K. Belkebir, A. Talneau, A. Sentenac, High resolution 3D quantitative imaging with tomographic diffractive microscopy, First EOS Topical Meeting on Frontiers in Optical Imaging, 16-18 septembre 2013, Murten, SUISSE.

专利：

1. 林强，阮乂，郑文强，阮丽梦，何祥，基于SERF原子磁力仪在生物磁场检测中的样品控温装置，中国, 发明专利, CN202110478500.6：申请日期：2021-04-30
   

2. 裴丽, 宁提纲, 祁春慧, 赵瑞峰, 阮乂, 董小伟, 郭兰, 吴树强. 基于阵列波导光栅和光纤光栅的微波/毫米波发生器. 中国, 发明专利, ZL200810116662.X： 授权日期：2011-06-22

3. 赵瑞峰, 裴丽, 祁春慧, 阮乂, 马中秀, 宁提纲, 董小伟, 郭兰, 吴树强. 偏振衰落和相位衰落可控的迈克尔逊光纤传感器, 发明专利, ZL200810225236.X： 授权日期：2011-03-02

4. 宁提纲, 裴丽, 祁春慧, 阮乂, 张帆, 王春灿, 董小伟, 谭中伟. 具有滤波功能的全光纤无色散可调光纤光栅衰减器. 中国, 发明专利, ZL200810224237.2： 授权日期：2010-06-09

5. 宁提纲, 胡旭东, 阮乂, 李坚, 朱宇, 马中秀, 白宏伟. 种子激光注入式有源光纤棒单模激光器. 中国, 发明专利, ZL200810118082.4： 授权日期：2010-02-10

6. 宁提纲, 阮乂, 胡旭东, 裴丽, 张帆, 王春灿, 刘楚, 谭中伟. 螺旋耦合有源掺杂光纤棒单模输出激光器. 中国, 发明专利, ZL200810118083.9： 授权日期：2010-01-13

7. 赵瑞峰, 裴丽, 祁春慧, 阮乂, 马中秀, 宁提纲, 董小伟, 郭兰, 吴树强. 马赫-曾德光纤干涉仪偏振衰落和相位衰落控制系统. 中国, 发明专利,ZL200810117204.8： 授权日期：2009-12-30

8. 裴丽, 赵瑞峰, 祁春慧, 宁提纲, 阮乂, 董小伟, 刘俊杰, 卓安生. 频域传输函数形状动态调谐光谱滤波器的制作方法. 中国, 发明专利,ZL200810116776.4： 授权日期：2009-12-30

9. 裴丽, 宁提纲, 董小伟, 延凤平, 祁春慧, 赵瑞峰, 阮乂, 吴树强, 刘俊杰. 温度不敏感的光纤光栅应力传感列车定位和实时追踪系统. 中国, 发明专利, ZL200810115274.X： 授权日期：2009-12-09

10. 宁提纲, 胡旭东, 裴丽, 祁春慧, 陈青艳, 阮乂, 董小伟. 单模有源光纤伴生耦合多模有源光纤超亮度单模激光器. 中国, 发明专利, ZL200810111817.0： 授权日期：2009-11-11
    

11. 宁提纲, 胡旭东, 郑晶晶, 祈春慧, 阮乂, 董小伟, 谭中伟, 刘艳, 童治, 裴丽. 单偏振双波长光纤光栅激光器产生微波、毫米波的装置. 中国, 发明专利, ZL200710177000.9：授权日期：2009-09-02
    

12. 宁提纲, 戴毅, 阮乂, 童治, 谭中伟, 裴丽, 张帆, 王春灿, 耿蕊, 史. 利用线型腔双波长光纤激光产生微波、毫米波的装置. 中国, 发明专利, ZL200710176999.5： 授权日期：2009-08-05
    

13. 宁提纲, 胡旭东, 陈青艳, 谭中伟, 刘艳, 裴丽, 阮乂, 张帆, 王春灿. 多根多模光纤组束超大功率单模激光器. 中国, 实用新型专利, ZL200820108432.4： 授权日期：2009-07-29
    

14. 宁提纲, 裴丽, 童治, 刘艳, 谭中伟, 阮乂, 胡旭东, 祁春慧, 李坚, 戴毅, 史. 单偏振多波长保偏取样光纤光栅激光器. 中国, 发明专利, ZL200710303818.0： 授权日期：2009-07-15
    

15. 裴丽, 宁提纲, 董小伟, 祁春慧, 赵瑞峰, 阮乂, 延凤平, 谭中伟, 刘艳. 基于AWG 和光纤光栅的多波长或/和多路单波长激光器. 中国, 实用新型专利, ZL200820108479.0： 授权日期：2009-06-24
    

16. 宁提纲, 胡旭东, 阮乂, 祁春慧, 郑晶晶, 李晶. 掺稀土光纤棒超亮度单模激光器. 中国专利, 实用新型专利, ZL200820109940.4： 授权日期：2009-06-17
    

17. 宁提纲, 祁春慧, 裴丽, 阮乂, 胡旭东, 许欧, 鲁韶华, 陈明, 戴毅. 共保偏光纤光栅可调谐单偏振双波长光纤激光器. 中国, 发明专利, ZL200710178044.3： 授权日期：2009-06-10
    

18. 裴丽, 祁春慧, 宁提纲, 赵瑞峰, 阮乂, 董小伟, 吴树强, 郭兰. 基于光纤耦合器和光纤光栅的微波/毫米波发生器. 中国, 实用新型专利, ZL200820109223.1： 授权日期：2009-06-03
    

19. 宁提纲, 郑晶晶, 胡旭东, 祁春慧, 阮乂, 裴丽, 董小伟, 郑凯, 简伟. 独立线型腔波长间隔可调单偏振双波长光纤光栅激光器. 中国, 发明专利, ZL200710178045.8： 授权日期：2009-06-03
    

20. 宁提纲, 胡旭东, 李晶, 阮乂. 有源光纤束大功率激光器. 中国, 实用新型专利, ZL200820110100.X： 授权日期：2009-05-27
    

21. 宁提纲, 裴丽, 董小伟, 胡旭东, 阮乂, 李晶, 祁春慧. 萨格纳克光纤环双路微波/毫米波发生器. 中国, 实用新型专利, ZL200820109224.6： 授 权日期：2009-05-06
    

22. 裴丽, 宁提纲, 李卓轩, 董小伟, 延凤平, 祁春慧, 赵瑞峰, 阮乂. 基于拉曼放大的分布式应力传感列车定位和实时追踪系统. 中国, 实用新型专利, ZL200820108739.4： 授权日期：2009-04-22
    

23. 宁提纲, 阮乂, 张帆, 王春灿, 谭中伟, 刘艳, 胡旭东. 线型腔单偏振双波长光纤光栅激光器的实现方法. 中国, 发明专利, ZL200710176169.2：授权日期：2009-04-22
    

24. 宁提纲, 李晶, 胡旭东, 裴丽, 祁春慧, 阮乂, 郑晶晶, 谭中伟. 可调谐光纤微波/毫米波发生器. 中国, 实用新型专利, ZL200820109043.3： 授权日期：2009-03-25
    

25. 宁提纲, 冯素春, 裴丽, 阮乂, 胡旭东, 祈春慧, 郑晶晶, 谭中伟, 许鸥, 鲁韶华. 线性腔多波长双路输出光纤激光器. 中国, 实用新型专利, ZL200820108295.4： 授权日期：2009-03-25
    

26. 宁提纲, 裴丽, 阮乂, 胡旭东, 郑晶晶, 祁春慧, 戴毅, 董小伟. 单偏振双波长光纤光栅激光器的实现方法. 中国, 发明专利, ZL200710176168.8：授权日期：2009-03-11
    

27. 宁提纲, 裴丽, 胡旭东, 祁春慧, 郑凯, 曹继红, 卫延, 郑晶晶, 阮乂. 基于扰偏器和保偏光纤的微波毫米波发生器. 中国, 实用新型专利, ZL200820079852： 授权日期：2008-04-10
    
    

在读研究生：

王嘉浩（2022级）

芦冠中（2022级）

陈佳丽（2022级）

刘雨菲（2023级）

已毕业博士生：
何祥（2016级，合作指导）- 博士后入站

已毕业研究生：

尹萍（2018级） - 工作

阮丽梦（2019级）- Universite de Bordeaux （France）- Doctoral 博士生

刘钒（2020级）

马曙光（2020级）

陈玉海（2021级）

彭志康（2021级）

李易筱（2021级）

向兆   （2021级）

科研项目：

1. 主持 国家自然科学青年基金 2018-2021
   

2. 主持 浙江省自然科学基金基础公益项目 2019-2022
   

3. 主持 浙江省属高校科研业务费 2019-2022
   

4. 主持 浙江工业大学重点培育项目 2019-2020
   

5. 参与 国家自然科学基金委区域创新联合基金（重点支持项目）（排名第二）2021-2025

Optics Express、Optik、Optical Fiber Technology等国际期刊审稿人。