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更新时间:2025.10.22
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孙东昌

| 博士 教授 博士生导师

单位:

职务: 教授

研究方向:

办公地址: 生工楼A429

办公电话:

电子邮箱: sundch@zjut.edu.cn

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  • 个人简介

    教授,博士生导师,美国微生物学会“Young Investigator”,法国图卢兹第三大学微生物学博士,加拿大英属哥伦比亚大学访问学者,中国微生物学会会员,中国遗传学会会员,中国化工学会会员,浙江省高校中青年学科带头人,浙江省微生物学会青委会副主任委员,浙江省微生物学会理事,研究方向为CRISPR基因编辑与微生物合成技术,开展I型CRISPR调控基础与应用研究开发产活性代谢产物的高版本微生物底盘细胞,先后主持国家自然科学基金3项、省级项目3项和重大横向项目,任法国国家科研署(ANR)项目评审专家、波兰/中国自然科学基金评审专家、苏黎世联邦理工学院学科带头人专项通讯评审专家、教育部研究生学位论文评审专家,通讯作者Nucleic Acids Res (2篇)Trends Plant SciBiotechnol AdvACS Synth BiolAppl Env Microbiol等主流期刊上发表科研论文30余篇,第一发明人申报国家发明专利11项,授权4项。任Front Microbiol期刊编委,Nucleic Acids ResNat CommunAdv SciAdv MaterCommun BiolChem Eng JCrit Rev MicrobiolBiotech&BioengmSphere、Virulence、Microbiol Res等SCI期刊论文评审专家,入选浙江工业大学青年英才支持计划获浙江工业大学优秀教师、优秀班主任、优秀本科生导师等荣誉称号,指导研究生获中国微生物学会2020年度和2023年度学术年会优秀学术报告奖,指导本科生参加iGEM大赛获金奖(2018, 2024),指导研究生/本科生获校级优秀学位论文多次。

  • 教学与课程

    一、主讲课程

    1. 研究生课程《生物技术前沿》

    2. 本科生课程《微生物学实验》、《合成生物学技术前沿与应用》


    二、主持教改项目

    1.微生物学技术双语课程教学体系的探索与实践(2017205)(已结题)

    2.面向留学生的《微生物学实验》全英文课程教改与实践(JG201733)(已结题)


    三、教改论文和教材

    1. 孙东昌. 通过现代微生物学技术课程教学培养研究生创新能力的实践[J]. 生物工程学报, 2021, 37(4):7.

    2.钟卫鸿,汪琨,裘娟萍,余志良,吕镇梅,杨胜利,赵春田,孙东昌,黄海婵. 微生物学数字课程. 高等教育出版社. 2020.


  • 育人成果

    1. 指导学生参加国际基因工程大赛获金奖(2024, 2018)

    2. 指导学生参加全国生命科学创新创业大赛获三等奖(2018,2023)

    3. 指导学生立项浙江省新苗计划(2021,2024)

    4. 指导学生获校级优秀硕士毕业论文和本科毕业论文(2018,2020)

    5. 指导研究生获“中国微生物学会学术年会”优秀学术交流奖(2020,2023)

    6. 指导研究生多次获浙江省微生物学会学术交流奖

    7. 作为班主任管理的班级获“校级先进班级”称号(2018)

    8. 获浙江工业大学“优秀青年教师”、“优秀班主任”、“优秀本科生导师”、“年度优秀教师”等称号

    9. 指导的研究生/本科生赴国内外一流高校深造


    部分同学去向:

    沈敏佳:法国巴黎萨克雷大学(攻读博士)

    俞明静:法国巴黎综合理工大学(攻读博士)

    陈梦圆:日本东京大学(攻读博士)

    费明月:浙江工业大学(本实验室转博)

    徐孟涛:浙江工业大学(本实验室转博)

    周琪:浙江工业大学(本实验室转博)

    姚夏:美国西北大学(攻读硕士)

    陈一扬:浙江大学(攻读博士)

    梁竟一:浙江大学(攻读硕士

    施铭:浙江大学(攻读硕士)

    蔡文凤:山东大学(攻读硕士

    刘超:厦门大学(攻读硕士

    付贝贝:上海科技大学(攻读硕士)

    刘芝芝:上海科技大学(攻读硕士

    尹小屿:苏州大学(攻读硕士

    茅呈耀:浙江工业大学(攻读硕士

    陈张瑱:华东理工大学(攻读硕士)

  • 科研项目

    主持科研项目


    1. 转录因子LeuO激活适应性免疫系统CRISPR/Cas防御大肠杆菌自然转化的机制,国家自然科学基金面上项目,2022-2025,58万元 

    2. StpA 调控自然感受态大肠杆菌中CRISPR/Cas 系统的机制研究,国家自然科学基金面上项目,2017-2020,62 万元

    3.质粒双链DNA转移导致细菌耐药的分子基础和调控机制,国家自然科学基金青年项目,2012-2014,22 万元

    4.新型兽药研制及耐药性控制技术研发—动物源细菌耐药性检测与控制技术研究开发,浙江省重点研发计划课题,2020-2022,50万元/285万元

    5. 多粘菌素生产菌多粘类芽孢杆菌C12遗传重组机制研究,浙江省自然科学基金委,2016-2018,10万元

    6. 抗性基因转移导致细菌耐药的防控研究,浙江省自然科学基金委,2011-2013,10万元


  • 科研成果

    一、近五年代表性论文(*通讯作者)

    1. Fei M#, Fang M#, Zhou Q, Chen Z, Gong M, Wu F, Tian C, Sun D*2025. Abundant bacterial nucleoid-associated protein H-NS limits plasmid transfer through mechanical modification of DNA. Nucleic Acids Res. 53:gkaf928. doi: 10.1093/nar/gkaf928(指导的博士研究生一作)

    2. Zheng H, Mao C, Chen S, Hou S, Sun D*2025.  A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux. Nucleic Acids Res. 53:gkaf693. doi:10.1093/nar/gkaf693(指导的硕士研究生一作)

    3. Noman M, Ahmed T, Gardea-Torresdey JL, Song F, Sun D*, Wang J*. 2025Stomata-centered nanoguardians: revolutionizing plant pathogen defense. Trends Plant Sci. 11:S1360-1385(25)00264-X. doi: 10.1016/j.tplants.2025.09.002. (指导的博士后一作)

    4. Jiao L, Zhou Q, Sun D*2025. CRISPR-based regulation for high-throughput screening. ACS Synth Biol. 14(6):1890-1904. doi:  10.1021/acssynbio.5c00076. (指导的硕士研究生一作)

    5. Zhang RZhou QHuang SZhang NSun D*2025. Advancements in CRISPR-Cas-based strategies for combating antimicrobial resistance. Microbiol Res. 13(8):2480-2491. doi: 10.1016/j.micres.2025.128232.  (指导的硕士研究生一作)

    6. Zhou QLi NJiao LSun D*. 2025. cAMP-CRP promotes ColE1 plasmid replication by reducing RNAI stability through transcriptional repression of hfq. Biochem Biophys Res Commun. 784:152668. doi: 10.1016/j.bbrc.2025.152668  (指导的硕士研究生一作)

    7. Liu SSun D*. 2025. Recent advances in metabolic engineering of Escherichia coli for riboflavin biosynthesis. World J Microbiol Biotechnol. 41(10):329. doi: 10.1007/s11274-025-04563-9. 

    8. Fang M, Zhang R, Wang C, Liu Z, Fei M, Tang B, Yang H, Sun D*2024. Engineering probiotic Escherichia coli Nissle 1917 to block transfer of multiple antibiotic resistance genes by exploiting a type I CRISPR-Cas system. Appl Env Microbiol. 10:e0081124doi: https://doi.org/10.1101/2024.04.01.587504.(指导的博士研究生一作)

    9. Mao C, Zheng H, Zheng H, Chen Y, Yuan P, Sun D*. 2024. Development of a type I-E CRISPR-based programmable repression system for fine-tuning metabolic flux towards D-pantothenic acid in Bacillus subtilis. ACS Synth Biol13(8):2480-2491. DOI: 10.1021/acssynbio.4c00256.  (指导的硕士研究生一作)

    10. Yuan P*, Xu M, Mao C, Zheng H, Sun D*. 2023Dynamically regulating glucose uptake to reduce overflow metabolism with a quorum-sensing circuit for the efficient synthesis of d-pantothenic acid in Bacillus subtilis. ACS Synth Biol12(10):2983-2995. DOI 10.1021/acssynbio.3c00315. (指导的博士后一作)

    11. Yu M, Hu S, Tang B, Yang H, Sun D*. 2023Engineering Escherichia coli Nissle 1917 as a microbial chassis for therapeutic and industrial applications. Biotechnol Adv67:108202. DOI: 10.1016/j.biotechadv.2023.108202.  (指导的硕士研究生一作)

    12. Sun D*, Sun X*, Hu Y*, Yamaichi Y*. 2023. Editorial: Horizontal gene transfer mediated bacterial antibiotic resistance, volume II. Front Microbiol. 14:1221606. doi: 10.3389/fmicb.2023.1221606 

    13. Hu S, Fei M, Fu B, Yu M, Yuan P, Tang B, Yang H. Sun D*. 2023. Development of probiotic E. coli Nissle 1917 for β‑alanine production by using protein and metabolic engineering. Appl Microbiol Biotechnol. 107(7-8): 2277-2288. (指导的硕士研究生一作)

    14. Chen Z, Shen M, Mao C, Wang C, Yuan P, Wang T, Sun D*. 2021. A type I restriction-modification system influences genomic evolution driven by horizontal gene transfer in Paenibacillus polymyxa. Front Microbiol. 12: 709571. DOI:10.3389/fmicb.2021.709571. (指导的硕士研究生一作)

    15. Sun D*#, Mao X#, Fei M, Chen Z, Zhu T, Qiu J. 2020. Histone-like nucleoid-structuring protein (H-NS) paralogue StpA activates the type I-E CRISPR-Cas system against natural transformation in Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 86:e00731-20. DOI:10.1128/AEM.00731-20指导的硕士研究生共同一作

    16. Fei M,Mao X,Chen Y,Lu Y ,Wang L,Yang J ,Qiu J,Sun D*. 2020. Development of a dual-fluorescence reporter system for high-throughput screening of L-aspartate-a-decarboxylase. Acta Bioch Bioph Sin. 52(12):1420-1426. DOI: 10.1093/abbs/gmaa134 指导的博士研究生一作)

    17. Sun D*, Jeannot K*, Xiao YH*, Knapp CW*. 2019. Editorial: horizontal gene transfer mediated bacterial antibiotic resistance. Front Microbiol. 10:1933. DOI: 10.3389/fmicb.2019.01933. 

    18. 卢亚兰, 唐标, 杨华, 孙东昌*. 2022CRISPR-Cas系统转录调控机制的研究进展. 微生物学报, 62(4):1308-1321. DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20210504 (指导的硕士研究生一作)

    19. 王晨羽, 刘芝芝, 唐标, 杨华, 孙东昌*. 2022利用CRISPR-Cas系统防控细菌耐药性的研究进展[J]. 生物工程学报,  38(4):1432~1445. DOI: 10.13345/j.cjb.210348 (指导的硕士研究生一作)

     

    二、申请/授权发明专利

    1. 一种穿梭质粒载体及其构建方法和应用,ZL201710873809.9,第一发明人,2020 (授权)

    2. 一种双荧光筛选β-丙氨酸合成酶的方法,ZL201910071013.0,第一发明人,2022 (授权)

    3.  β丙氨酸合成酶突变体、编码基因、基因工程菌及应用,ZL201710873809.9,第一发明人,2022 (授权)

    4. 一种高产β-丙氨酸的工程菌及其应用,ZL2022110297108,第一发明人,2025 授权

    5. 一种高产D-泛酸的益生工程菌及其在产D-泛酸和制备益生菌添加剂中的应用2023102905322第一发明人,2023 (实审

    6. 一种靶向识别切割多耐药基因的EcN工程菌及其构建方法与应用,2023107976339,第一发明人,2023 (实审

    7. 一种基于I型CRISPR-Cas系统的优化型基因表达调控工具及应用,第一发明人,2023083101329010,2023 (实审

    8. 一种I-ECRISPRi系统及在构建高产D-泛酸工程菌中的应用. 第一发明人,申请号:202410827744.4(实审

    9.  一种基于 I 型 CRISPRi 筛选系统构建的高产 β-丙氨酸工程菌及方法第一发明人,申请号:202510086377.1(实审

    10. 一种以隐秘质粒为表达载体的高产 β-丙氨酸的工程菌及双碳源发酵方法. 第一发明人,申请号:202510092402.7(实审

    11.  基于群体感应的I型CRISPRi系统及在构建动态基因调控工程菌中的应用. 第一发明人,申请号:202510707319.6(实审




  • 社会服务

    1. 法国国家科研署(ANR)项目评审专家

    2. 波兰国家自然科学基金评审专家

    3. 苏黎世联邦理工学院学科带头人专项通讯评审专家

    4. 国家自然科学基金同行评审专家

    5. 教育部研究生学位论文评审专家

    6. Front Microbiol期刊特邀副编辑

    7. Nucleic Acids Res、Nat Commun、Adv Sci、Adv Mater、Chem Eng J、mSphereSynth Syst Biotechnol、Biotechnol J、Appl Biochem Biotechnol、Eng Microbiol期刊论文审稿人

    8. 浙江省微生物学会青年委员会副主任委员

    9. 浙江省微生物学会理事

    10. 浙江省科普协会会员

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