吴石金

吴石金，健行特聘教授，博士生导师，国家实验教学示范中心主任，教育部评估中心专家组成员、中国工程教育认证协会专家组成员，浙江省高校中青年学科带头人，入选浙江省高校优秀青年资助计划；研究兴趣在医药中间体生物制造、细胞基因工程、新酶资源挖掘与改造、新型生物反应器与工业化应用等；在微生物细胞工厂、全局调控因子和代谢途径解析方面有很好的研究基础，可为典型医药中间体的生物制造、高值化合物合成、碳资源循环利用和环境生物修复提供技术支持。目前所在团队的研究方向包括酶资源挖掘与应用、新型生物反应器及生态学应用、酵母合成生物学与产业化、新型化合物生态安全等4个方向。近5年主持国家和省部级项目10余项，合作参与荣获教育部高等学校科学研究自然科学二等奖1项，浙江省科学技术一等奖1项及江西省自然科学三等奖1项；发表SCI、EI收录论文50余篇，出版著作8部，获批国家授权发明专利16项，国际专利2项。

生物技术国家级一流专业建设点负责人，生物化学国家级线上一流课程负责人，国家级虚拟仿真一流课程负责人，浙江省精品在线开放课程负责人，高教社数字课程负责人；主持省部级以上教学改革与建设项目16项，主编国家级规划教材8部，获国家级教学成果奖1项、省级教学成果奖2项，发表教改论文30余篇。

1.代表性论文

2025年

1.Shijin Wu, Fang Chen, Xiaojun Ma, Shiyi Sun, Hongde Yan,Tongtong Li, Lequan Qiu. Asymmetric reduction of (E/Z)- citral to (R)- citronellal by a cyanobacterial-derived old yellow enzyme, CtOYE. Applied Biochemistry and Microbiology 264 (2025) 130427,  in press

2024年

1.Hao Xu, Nuo Xu, Yanhui Li, Jie Sun, Tingheng Zhu, Shijin Wu (通讯). Effects of the constructed (+)-limonene synthesis pathway in sake yeast on the Brewing flavor of sake. Archives of Microbiology and Immunology. 8 (2024): 221-232,  doi.10.26502/ami.936500169 

2.Shijin Wu, Xiaojun Ma, Hongde Yan. Identification and characterization of an ene-reductase from Corynebacterium casei. International Journal of Biological Macromolecules 264 (2024) 130427,  https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.13042

3.Lequan Qiu, Yanan Fu, Xianda Zhou, Mengyuan Bao, Chenyu Li, Shijin Wu (通讯). Mechanisms and high-value applications of phthalate isomers degradation pathways in bacteria. World Journal of Microbiology and Biotechnology 40 (2024)247-251,   https://doi.org/10.1007/s11274-024-04060-5

4.Tongtong Li, Baohua Xu, Hao Chen, Ying Shi, Jun Li, Mengwei Yu, Shijin Wu (通讯). Gut toxicity of polystyrene microplastics and polychlorinated biphenyls to Eisenia fetida: Single and co-exposure effects with a focus on links between gut bacteria and bacterial translocation stemming from gut barrier damage. Science of the Total Environment,  908(2024):168254 https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.168254

2023年

1.Shijin Wu, Qiang Wang, Xiaojing Ma, Lequan Qiu, Hongde Yan. Modulation of the catalytic performance of OYE3 by engineering key residues at the entrance of the catalytic pocket. Biotechnol Appl Biochem. 2023;70:1720–1730   https://orcid.org/0000-0002-8099-5225

2.Jie Li , Wenjia Fan, Xuehan Zou, Xuan Dai, Yueyue Zhao, Hongying Pan, Shijin Wu (通讯), Xi Li*, Haijun Huang*. Clinical evaluation of polymerase chain reaction coupled with quantum dot fluorescence analysis in the identification of bacteria and yeasts in patients with suspected bloodstream infections. Microbial Biotechnology, 255 (2023):1-11   https:// doi.org/10.1111/1751-7915.14226

3.Lequan Qiu , Chenyu Li, Yanan Fu, Ying Wang, Zijie Zhang, Zhi Zuo, Ruifeng Chen, Xinge Yin,  Tongtong Li,, Shijin Wu (通讯). Biodegradation of phthalate isomers by newly isolated Klebsiella variico SY1  and its functional genomic analysis. Interational Biodeterioration and Biodegradation, 178 (2023):105557    https://doi.org/10.1016/j.ibiod.2022.105557

4.Tongtong Li, Hao Chen, Baohua Xu, Mengwei Yu, Jun Li, Ying Shi, Shijin Wu (通讯). Deciphering the interplay between LPS/TLR4 pathways, neurotransmitter, and deltamethrin-induced depressive-like behavior: Perspectives from the gut-brain axis. Pesticide Biochemistry and Physiology,  197(2023):105697  https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2023.105697

2022年

1. Tongtong Li, Mengtian Lu, Baohua Xu, Hao Chen, Jun Li, Zhenzhen Zhu, Mengwei Yu,Jiaoyang Zheng, Peilong Peng, Shijin Wu (通讯).Multiple perspectives reveal the gut toxicity of polystyrene microplastics on Eisenia fetida: Insights into community signatures of gut bacteria and their translocation. Science of the Total Environment, 838 (2022):156352  http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.156352

2. Tongtong Li, Dongcan Tian, Mengtian Lu, Bijiao Wang, Jun Li, Baohua Xu, Hao Chen, Shijin Wu(通讯). Gut microbiota dysbiosis induced by polychlorinated biphenyl 126 contributes to increased brain proinflammatory cytokines: Landscapes from the gut-brain axis and fecal microbiota transplantation.Ecotoxicology and Environmental Safety, 241 (2022):113726 https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2022.113726

3. Shijin Wu*, Bijiao Wang, Hongde Yan. Semi-rational protein engineering of a novel ene-reductase from Galdieria sulphuraria for asymmetric reduction of (R)-carvone and ketoisophorone. Biotech and App Biochem, (2022):1–10   http://doi.org/10.1002/bab.2391

2021年以前

① Wu Shijin*; Wu Mei; Tian Dongcan; Qiu Lequan; Li Tongtong*; Effects of polystyrene microbeads on cytotoxicity and transcriptomic profiles in human Caco-2 cells , Environmental Toxicology, 2020, 35: 495-506.

② Li Tongtong; Tian Dongcan; Zhu Zhenzhen; Jin Weihua; Wu Shijin*(通讯); Li Huan*; The gut microbiota: a new perspective on the toxicity of malachite green (MG), Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103: 9723-9737.

③Wu S, Zhu Z, Chen J, Wu M, Qiu L.Transcriptomic analyses of human bronchial epithelial cells BEAS-2B exposed to brominated flame retardant (tetrabromobisphenolA). Environmental Toxicology. 2019; 34:742–752.

④Yinjun Zhang * , Jialin Chen , Changsheng Chen and Shijin Wu *(通讯). Isolation of a Bacillus Aryabhattai Strain for the Resolution of (R, S)-Ethyl Indoline-2-Carboxylate to Produce (S)-Indoline-2-Carboxylic Acid.Catalyst.2019; 9：206-218.

⑤Tongtong Li， Mengting Qi， François-Joël Gatesoupe， Dongcan Tian， Weihua Jin， Jun Li， Qiang Lin, Shijin Wu（通讯） Huan Li. Adaptation to Fasting in Crucian Carp (Carassius auratus): Gut Microbiota and Its Correlative Relationship with Immune Function. Microbial Ecology. 2019; 78:6–19.

⑥Zhang YJ, Chen CS, and Wu S(通讯). Purification, identification and characterization of an esterase with high enantioselectivity to (S)-ethyl indoline-2-carboxylate. Microbial and Enzyme Technology. Biotechnology Letters. 2019; 41: 1223–1232

⑦Wu S, Zhu Z, Chen J, Wu M, Qiu L. Transcriptomic analyses of human bronchial epithelial cells BEAS-2B exposed to brominated flame retardant (tetrabromobisphenol A). Environmental Toxicology. 2019; 34: 742– 752.

⑧Wu S, Wu M, Qi M, Zhong L, Qiu L. Effects of novel brominated flame retardant TBBPA on human airway epithelial cell (A549) in vitro and proteome profiling. Environmental Toxicology. 2018;33:1245–1253.

⑨Qiaozhen Feng, Li Zhong, Shibo Xu, Lequan Qiu, and Shijin Wu(通讯). Biomarker Response of the Earthworm (Eisenia fetida) Exposed to Three Phthalic Acid Esters. ENVIRONMENTAL ENGINEERING SCIENCE.2016,105:1-14.

⑩Shijin Wu, Yuan Li, Penghua Wang,Li Zhong,Lequan Qiu,and Jianmeng Chen. Shifts of Microbial Community Structure in Soils of a Photovoltaic Plant Observed Using Tag-encoded Pyrosequencing of 16S Applied Microbiology and Biotechnology 2016,100:3735-3745

⑩Lequan Qiu,Xinge Yin,Hanyu Zhang,Guomei Chen,Shijin Wu(通讯). Biodegradation of bis(2-hydroxyethyl) terephthalate by a newly isolated Enterobacter sp.HY1 and characterization of its esterase properties.Journal of Basic Micerbiology 2020,8:699-711  https://doi.org/10.1002/jobm.202000053

2. 科研获奖

 ①获奖：含氮硫氯污染物的生物净化及强化原理， 教育部自然科学奖二等奖，2011

 ②获奖：典型污染物催化/生物降解强化机制研究，浙江省科学技术奖一等奖，2014

 ③获奖：法氏囊及其三肽囊素免疫生物学研究，江西省自然科学奖三等奖，2007

3. 授权发明专利16项，已实现产业化6项。

国内专利：

气单胞菌YQ及在酶法制备L-瓜氨酸中的应用. 发明专利ZL201510412709.7

一种从新鲜紫苏茎叶中提取的原花青素及其应用. 发明专利ZL201610776100.2

环状芽孢杆菌WZ-12及其在微生物分解处理二氯甲烷中的应用(授权：ZL200710067510.0)

链霉菌S1-5及其应用 (授权,专利号：ZL200710156460.3)

降解三苯VOCs废气的复合微生物菌剂的制备方法(授权,专利号：ZL200810063737.2)

降解尼古丁新菌株—假单胞菌ZUTSKD及其应用(授权,专利号:ZL200710070805.3)

一种用于蛋白质组学分析的动物蛋白质样品的制备(授权ZL2011102075104843.X)

国际专利：

Plasmid pRC12 and Its Application in Microbial Degradation of Halogenated Hydrocarbon Pollutants(Patent number: 2020101839)  澳大利亚革新专利

A Lactobacillus Brevis ZJ401 with antioxidant activity and its application（Patent number: 2020101589）澳大利亚革新专利

  主持或参与承担各级纵横向科研项目20余项，主要有：

1.国家自然科学基金面上项目：适用于土壤POPs污染风险预测和诊断生物标记物的筛选和评价模型的建立(20977087);

2.国家863计划项目：空气净化器与示范应用(净化用菌种和关键酶研究与应用);

3.国家自然科学基金：大肠杆菌K5产肝素前体heparosan代谢控制研究（21076195/B0608）;

4.国家自然科学基金：MTBE微生物降解的机理与活性增强（20476099/B0611）;

5.浙江省自然科学基金项目：高效吸收CO2提升沼气能源品位的新型藻菌光电生物膜反应器(LGF22E060004)

6.浙江省自然科学基金项目：基于AHLs调控的新型脱氮电生物膜及其可视化研究（LY18E090010）;

7.浙江省自然科学基金项目：利用蛋白质组学技术筛选POPs污染土壤生物标记物研究（Y5090054）;

8.浙江省自然科学基金项目：光伏产业区土壤微生物多样性环境安全研究（LY13B070008）;

9.浙江省科技计划公益项目:钱塘江上游各水系(衢州段)持久性有毒物质的调查与风险评估（2010C32017）;

10.浙江省创新团队项目:工业废气生物净化微生物资源菌种库建设（2011R09048-01）;

11.浙江省科技厅项目：生物新农药-广谱抗菌杀螨素的研制（2006C32017）。

12.浙江省基础公益研究计划项目：高效吸收CO2提升沼气能源品位的新型藻菌光电生物膜反应器（LGF22E060004）

  主持国家级一流课程2门,承担本科生《生物化学》教学工作，开创性地提出并实践了“亮·考·帮”线上线下混合式教学模式，主持国家级一流课程2门、浙江省级精品在线课程2门、浙江省虚拟仿真课程1门、浙江省普通高中网络课程1门；探究产教融合模式，倡导课堂与产业的融通互动；以国家级实验教学示范中心为平台，以创新实验项目为桥梁，通过课外科技活动激发学生学习兴趣，推进课程教学水平提升；倡导课外科创活动源于科研项目，继而反哺课程，学生可以在课堂学习中迸发出课外科技活动的创新灵感，而学生的创新实验计划项目、竞赛题目和作品等，又可引入课堂教学，让更多的学生受益。

  课程建设与教材建设与时俱进。根据学情结合现代教育教学技术发展特点，20余年来，不断地进行教学手段改革和创新。教学课件从最初的教学挂图→幻灯片→投影片→多媒体课件；从“生物化学计算机辅助教学CAI软件”到开发应用《试卷自动生成系统》；学生作业从手写书面作业→学校机房应用《导师系统DOS版》，《导师系统WINDOWS版》→《导师系统网络版》→《导师系统网络在线版》；考试题库从单一的卷面闭卷考试→网上在线测试→探索线上和线下融合，过程性评价与总结性评价相结合的多元化考核评价模式。教学改革工作始终“走在前列，勇立潮头”，开创性地应用现代教育教学技术手段实施教学，取得了不错的教学效果，在国内教育界产生了较大的影响力。

   教学获奖

1. 2023年，“三维耦合 三链融合” 培养生物工程科技创新人才”，国家优秀教学成果二等奖，第4获奖人。

2. 2021年，“三维耦合 三链融合” 培养生物工程科技创新人才”，浙江省优秀教学成果特等奖，第3获奖人。

3. 2019年，“依托优势学科 突出集成创新，构建面向先进生物制造的特色工科人才培养新模式”，浙江工业大学优秀教学成果一等奖，第1获奖人。

4. 2016年，“基于OBE工程教育专业内部教学评价与质量保障体系的构建与实践”，浙江工业大学优秀教学成果一等奖，第2获奖人。

      成果数据

   学生培养

1. 指导本科生

       迄今已累计指导30余名学生的毕业设计（毕业论文）。近5年，担任16位本科生的导师，其中，在校5人；指导毕业论文（设计）11人，3人优秀，8人优良，全部按时毕业，5人继续出国读研深造，达45%。

2. 指导博士、硕士研究生

        迄今已累计联合指导博士、硕士研究生25名，近5年，担任12位研究生的第一导师，在校6人，6人全部合格毕业；其中：1人担任学院研究生会主席，2人担任研究生党支部书记。

3. 组织和指导学科竞赛

        组织国际遗传工程机器大赛（iGEM）、全国生命科学竞赛、全国节能减排科技竞赛和生物创新设计大赛，并亲自指导学生25人次参赛。

   成果推广应用

1.出版专业核心课程教学用书

    新形态教材《简明生物化学原理》、《生物化学（数字教材）》、《生物化学实验指导》，以及配套的多媒体课件，迄今有160多所高校使用。2008年中国轻工出版社出版了吴石金主编的教学辅助教材《生物化学学习指导》和《生物化学实验指导》，145所高校使用，评为考研最受欢迎复习资料，赢得了广泛好评。配套的多媒体课件已被广泛下载使用。

2.推进校内外优质课程的应用和共享

   积极推广国家精品课程、国家精品资源共享课程的教学成果和经验；在候选人的带领与组织下，《生物化学》已列为国家首批一流课程，本校《微生物学》和《生物工程设备》成为国家精品课程和国家精品资源共享课程，《生物钟与健康》建设成为国家精品视频公开课程，做好优质课程的应用和共享。《生物化学》和《基因工程》先后成为浙江省精品课程，《微生物学》建设成为浙江省精品在线课程，《细胞生物学》成为校优秀课程。

3. 在全国教学研讨会推广课程建设经验

   应邀在全国教学会议上做大会报告60余次，介绍课程建设进展和成果，获得国内同行的一致好评。

（1）2019年11月24日，在浙江理工大学举行的“全国生物化学教学研讨会议”上作主题报告介绍“生物化学线上线下混合教学的经验和体会”；

（2）2017年10月14日，在南昌举行的“生物技术生物工程专业教学指导委员会会议”上作主题报告“生物工程教育认证背景、意义和经验体会”；

（3）2010年10月22-24日，在太原举行的全国第五届“高校生命科学教学论坛”，作分组报告“工科生物学课程建设的体会——注重现代化教学手段的开发与应用”；

（4）2011年7月12-14日，在南昌大学举行的全国第六届“高校生命科学教学论坛”上作大会报告“基于网络技术的生物化学及其实验分层教学法”；

（5）2012年10月19 -21日, 在杭州师范大学举行的第七届高校生命科学教学论坛，并作报告“国家精品课程建设与转型中的一点实践与思考”；

（6）2013年5月18日在福州举行的全国第八届“高校生命科学教学论坛”，作特邀报告“2011建设与国家精品资源共享课程建设”；

（7）2013年7月20日,在南京师范大学举行的第十四届全国微生物学教学和科研及成果产业化研讨会作大会报告“国家精品课程向国家精品资源共享课程升级中的一点体会与实践”。

4. 通过教学沙龙和教学讲座传授教学经验

  以学校教师发展中心组织的教学论坛、教学沙龙、观摩课、示范课、新教师培训班、午间名师汇等活动为平台，积极向年轻老师传授自己几十年在教学工作、教学研究中获得的经验，例“教学方法研究与应用的一点体会”、“教学资源的利用与开发”、“说课比赛注意事项”、“教改项目申报与结题”等。

5. 通过“新老教师结对”辅导传授教学技能，帮助年轻教师提高教学技能，指导年轻教师比赛获胜，成绩显著：

（1）赵嫚老师在2016年浙江省高校第九届青年教师教学技能竞赛中荣获特等奖；

（2）汤晓玲老师在2017年浙江工业大学第十届青年教师讲课比赛中获“十佳”称号；

（3）汪琨老师在2010年浙江省高校第六届青年教师现代教学技能比赛中获优秀奖；

（4）柯霞老师在2012年浙江工业大学第八届青年教师讲课比赛中获 “优胜”奖；

（5）钟莉老师在第四届全院青年教师讲课比赛暨教学现代化技能比赛中获二等奖；

（6）黄海婵老师第八届全院青年教师讲课比赛暨教学现代化技能比赛中获一等奖。

6. 帮助新入职教师，通过指导助课传授上课经验

    生物化学课程组近几年引进了多位年轻老师，每位老师都经历助课训练。通过全程听课、批改作业、参与小班研讨课、参与出卷改卷、参与网站后台答疑等课程的各个环节，迅速提高教学水平。课程组赵嫚老师在2016年浙江省高校第九届青年教师教学技能竞赛中荣获特等奖；汤晓玲老师在2017年浙江工业大学第十届青年教师讲课比赛中获“十佳”称号；汪琨老师在2010年浙江省高校第六届青年教师现代教学技能比赛中获优秀奖。

    此外，作为中国工程教育认证协会现场考察专家，参与华南理工大学、绍兴文理学院、浙江嘉兴大学、浙江科技大学本科专业审核评估工作；参与西安理工大学、福建师范大学、南昌航空大学中国工程教育专业认证工作。应邀到吉林大学、华南理工大学、福建农林大学、衢州学院、三峡大学、杭州师范大学、海南大学等60余所高校做教学报告，接受大连理工大学等70余所高校来校调研卓越工程师培养、实践教学改革、实验教学中心建设等工作，相关教学成果在省内高校和全国地方院校得到推广应用，受到《中国教育报》、《浙江教育报》、《浙江在线》和《杭州日报》等主流新闻媒体的报道和关注。